根据税务总局公告（2016）7号规定，税务总局对纳税信用A级的增值税一般纳税人取消发票认证。所谓取消认证是指，纳税人取得销售方使用增值税发票系统升级版开具的增值税发票，可以不再进行扫描认证，通过增值税发票查询平台，查询、选择用于申报抵扣或者出口退税的增值税发票信息，即增值税专用发票在线免扫描认证。实务操作是“扫描认证”变成“网络认证”。那么在实际操作过程中，会遇到有哪些常见问题，该如何处理呢？
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　　一、登录系统提示纳税人档案信息不存在，如何处理？
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　　请确认是否属于纳税信用A级企业，如果是A级企业，则可能为税务局端的档案信息维护问题，此类情况需联系主管税务机关进行核实。
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　　二、发票勾选功能可以查询的发票范围是什么？
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　　1、由增值税发票管理新系统开具以及3月1日起使用扫描认证方式采集的、尚未申报抵扣（或退税）的增值税专用发票、货物运输业增值税专用发票、机动车销售统一发票信息：
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　　1）发票状态为正常且未超过抵扣时限（按月申报纳税人为本月1日的前180日，按季度申报纳税人为本季度首月1日的前180日）的发票；
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　　2）发票金额为正数的发票。
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　　三、确认勾选操作每个月能够执行几次？是必须执行的吗？
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　　1、确认勾选操作是对当月所有已勾选发票的最终确认，一旦确认，系统将对数据进行处理，因此每个月只能执行一次，确认之后将无法回退。
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　　2、系统有自动执行确认操作的功能，如果纳税人当月勾选了发票，忘记执行勾选确认操作，系统会在每月最后1日的22点自动将所有已勾选的发票信息进行自动确认。
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　　3、如纳税人当月未勾选发票，无需专门执行勾选或确认操作。
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　　4、若纳税人确认勾选之后，当月仍有发票需要抵扣（或退税），可进行扫描认证。
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　　四、何时能够对发票进行勾选处理操作？
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　　每月确认勾选操作完成之前的任意一日均可，最晚为当月最后1日的22点之前。
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　　五、可以对哪些发票进行发票勾选操作？
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　　来源于电子底账系统且状态为正常、金额为正数的发票。
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　　六、什么情况下不可以执行发票勾选或撤销勾选操作：
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　　1、当前月份已经执行过确认勾选操作（包括每月最后1日22点系统自动确认的）；
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　　2、发票状态为非正常（含作废、失控、红冲等）的发票；
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　　3、已通过扫描认证的发票（默认置为已勾选状态且不可变更，说明纳税人已通过扫描认证的方式采集了发票信息）。
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　　七、同一张发票既进行了发票勾选，又使用了扫描仪进行扫描认证，有什么影响？
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　　通常以扫描认证为准（扫描认证结果通常先于勾选操作保存到税局端的税控系统），因此不会出现重复抵扣的问题。建议纳税信用A级的纳税人优先使用更为方便、高效的增值税发票查询平台替代原有扫描认证的方式。
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　　八、收到的纸质发票在增值税发票查询平台的发票查询、发票勾选功能中始终无法检索到，原因是什么，如何处理？
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　　1、系统的数据同步周期至少需要1天，因此当天开具的发票无法在本平台进行检索；
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　　2、此份发票的状态为非正常，且超过2个月；
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　　3、此份发票已经超过抵扣时限；
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　　4、此份发票在以前已经申报抵扣过了；
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　　5、此份发票电子数据属于历史数据，尚未进入本系统处理的范围；
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　　6、税务局端的相关系统、网络出现故障，导致相关发票数据未能及时的同步到本系统；
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　　7、开票方未上传发票信息或者为假发票。
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　　月末未查询到发票信息，可能影响纳税人次月的正常申报抵扣（或退税）业务，则建议纳税人仍使用扫描认证的方式。
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　　九、批量勾选的文件格式有何要求？
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　　1、excel 2003格式的xls文件；
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　　2、单元格内容依次为发票代码、发票号码、开票日期、是否勾选；
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　　3、所有单元格为文本格式，开票日期为YYYY-MM-DD格式的数字，勾选状态只能为：是、否。上传文件前，请先核对需要勾选的发票状态是否为“是”，否则无法实现批量勾选处理。
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　　十、发票勾选结果是否可以撤销？
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　　在尚未完成当月的勾选确认操作前，纳税人可以撤销之前的勾选操作结果。
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　　十一、确认勾选抵扣时是否要求取得纸质发票？
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　　在进行勾选抵扣时，应取得纸质的发票。
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　　十二、若企业新一年的纳税信用评价降级了，可以继续使用该系统吗？
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　　企业使用发票查询系统后，纳税信用级别下降后，可继续使用该系统进行勾选抵扣的操作。
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　　十三、在办税大厅查询的认证结果通知书包括勾选确认的进项税额吗？
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　　办税大厅查询的认证结果包括扫描认证以及勾选确认的进项税额。

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